JScript.NETはJScriptのVer.7にあたるもののようです。
どう変わったかというと、
・スクリプトから言語になった
・巨大な.NET Frameworkのライブラリを使うようになった
という感じでしょうか。ちょっとお手軽さは失われたようです。
どうせコンパイルするんだったらC#を使えば、という気もしますが、 とりあえず最新のJavaScriptはチェックしていこう、 ということでいいんじゃないでしょうか。 連載は、言語編・ライブラリ編に分かれて進んでいきます。