〈新造船の場合〉
＊ 船舶建造
↓
＊ 船舶総トン数測度申請（管海官庁）
↓
＊ 船舶件名書謄本交付（管海官庁）
↓
＊ 保存登記申請（法務局）
↓
＊ 登記簿謄本交付（法務局）
↓
＊ 船舶登録申請（管海官庁）
↓
＊ 船舶国籍証書交付（管海官庁）
↓
＊ 航行
〈所有者変更の場合〉
＊ 船舶登記簿謄本交付申請（法務局）
↓
＊ 変更登録及び船舶国籍証書書換申請（管海官庁）
〈所有者変更及び船籍港変更の場合（他管内へ転籍）〉
所有者変更の場合と同じ
〈抹消登録の場合〉
○ 国籍喪失
抹消登録申請（管海官庁）
添付書類
@ 運輸大臣の許可書
A 船舶国籍証書
B 売買契約書
C 船舶譲渡許可書
D 通関証明等
○ 解撤による抹消
抹消登録申請（管海官庁）
添付書類
@ 船舶国籍証書
A 証明書（船舶測度官が船舶同一性の確認後に発給するもの）
〈その他の場合〉