隠し曲は以下の条件の他にも、 Arcadeモードのプレイ時間が多いと出現します。 曲選択時にSelectを押すことでハイパー譜面になる曲があります。
注：キャラ名の後の()はキャラのバージョン。複数ある場合に明記。
(5：Pop'nMusic5版、6：Pop'nMusic6版、St：Pop'nStage版)
| Stage | 曲名 | 出現条件 |
|---|---|---|
| 1 | TROPICAL | MyキャラにUOWOを選ぶ |
| 1 | J-DANCE | MyキャラにJUDY(5、St)を選ぶ |
| 1 | KUNG-FU | (9Keysのみ出現)
MyキャラにPop'nStage隠し曲担当(FAT BOY、TROPPIE、DICK、SHOLLKEE、JUDY(St)、MILLY、DRAGON、Mimi(St)、ROMA、THE MOCKEY、INUCHIYO)を選ぶ |
| 1 | MIND | MyキャラにBOY(6)を選び、Stage1〜3を全てボーダクリア |
| 1 | KIDS | Normalモードの9Keysで250000点以上 |
| 2 | 80'S POP | Stage1でスコアに8を含む |
| 2 | FOLKY | Stage1でMaxCombo49以上 |
| 2 | SKA CORE | (9Keysのみ出現)
MyキャラにDAMI-YAN、Stage1でJ-TEKNOを選ぶ |
| 2 | SCAT | MyキャラにSUMIRE、Stage1でSYMPATHYを選び80000点以上 |
| 2 | SPIRITUAL | MyキャラにTRAN、Stage1でSYMPATHYを選ぶ |
| 2 | SWING | MyキャラにSANAE-chanを選び、Stage1でMaxComboの下一桁が3、7 |
| 3 | GIRLS POP | (1)Stage1とStage2でANIME HEROINE、SANBA、MUSICAL、
JODERを選び90000点以上
(2)Stage1でMaxCombo250以上、Stage2でMaxCombo300以上 |
| 3 | BLUES | (1)Stage1とStage2を66666点またはMaxCombo6、66、666で揃える
(2)Stage1で100000点、Stage2でMaxCombo500以上 |
| 3 | FUNK | (9Keysのみ出現)
MyキャラにFAT BOY、Stage1またはStage2でROCK'N ROLLを選ぶ |
| 3 | HOUSE | Stage1またはStage2でSAZAE SANを選びBAD33以下 |
| 3 | SPANISH | (9Keysのみ出現)
Stage2でROMANCE KAYOUを選び70000点以上 |
| 3 | REGGAE | Stage2でSANBAを選びMaxCombo38以上 |
| 3 | CLASSIC6 | Stage1でJODERを選び85000点以上、 Stage2でROMANCE KAYOを90000点以上かつMaxCombo60以上 |
| 3 | OI PUNK | Stage1でUS HARDROCK、Stage2でMELOCOREを選ぶ |
| Exp | GAMBLER COURSE | Normal/ChallengeモードでBLUESをプレイ |
| Exp | SANA COURSE | Expertモードでパーキッツコース(CELT)をプレイ |
| Exp | POWER COURSE | Normal/ChallengeモードでPOWERFOLK7をクリア |
| Exp | GIRL COURSE | Normal/ChallengeモードでGIRLS POPをプレイ |
| Exp | WORLD COURSE | ExpertでCS6コース(STREET、DRAMATIC、ROMANCE KAYOU)をプレイ |
| Exp | ROCK COURSE | Normal/ChallengeモードでHIP ROCKをクリア |
| Exp | MIKKY MASASHI COURSE | Normal/ChallengeモードでFUNKROCK、US HARDROCKをプレイ |
| Exp | SECRET COURSE | Normal/ChallengeモードでAC6新曲(EVER POP〜SHOGUN)を全てプレイ |
| Exp | POP'N STAGE COURSE | Normal/ChallengeモードでFOLKY、HOUSEをプレイ |
| Exp | HELL1to5 COURSE | Normal/Challengeモードの全曲(GIRLS POP〜POWERFOLK7)をプレイ |