エヴァンゲリオンには、様々な学術用語が使われております。これらは、一般に「飾り」、「衒学趣味」、「底が浅い」などと評されるだけで、物語との関連を考察しようとした試みは全くありませんでした。ここでは、この試みを「エヴァンゲリオン学」と名付け（この言い方では意味がちょっとずれますが…）、取り組んでみたいと思います。
［総論］死と新生の原理
１．遺伝子
第７話において、シトについての資料が一瞬現れます。その中で確認できる文字が、「アポトーシス：発生」と「アポビオーシス：生体防御」です。
アポトーシスとは、遺伝プログラムの中に最初から組み込まれている細胞の致死機能です。つまり、外的な傷害がなくとも、細胞が死ぬための機能です。具体的には、各指がくっついた状態である赤ん坊の手に対し、自動的に一部の細胞が破壊されることにより、各指は独立して動けるようになります。また、DNAの損傷などにより、問題が起きた遺伝子を殺すことにより、生命体としての維持を行うなどの目的もあります。
一言でまとめると、不要な細胞を殺すことで生命体が生きるための機能です。
アポビオーシスは、アポトーシスの細胞致死機能のうち、特に神経細胞に働くものをいいます。これは、「寿命」を決める機能とも言えるでしょう。
NERV資料において、アポトーシスが発生と結びついているのは、おそらくアポトーシスの形態作成機能（不要な細胞を取り除き生命体としての目指す形状に到達する）を意味しており、アポビオーシスが生体防御と結びついているのは、シトは自らのアポビオーシスを抑えることができる（寿命がない）ことと共に、外敵に対しての攻撃力にアポビオーシスを転化することができるということでしょうか。ただし、自爆的行動を見せたシトもいることから考えるとシトにとってはアポビオーシスも自分に向かうことがあるようです。
結局、シトの分析において、アポトーシスとアポビオーシスが第一に登場していることは、シトの驚異的な生命力および攻撃力はこれらの機能を自在に活用していることからきていると言うことでしょう。
アポトーシス、アポビオーシスの他に、エヴァで登場するのはネクローシス、マイトーシスなどです。ネクローシスは、アポトーシスとは異なり、外的な障害などによる細胞死を表し、マイトーシスは細胞分裂を表します。NERVにおいては、赤木博士のもと、エヴァンゲリオンのアポトーシス作業、マイトーシス作業、ネクローシス作業などが行われていました。
これらの言葉から推測されるエヴァンゲリオンの生体部分に関してのコピーおよび維持の作業の内容は、
・マイトーシス作業による細胞の分裂
・アポトーシス作業による不要部分の除去および問題がある部分の除去（生体の形成・維持）
・ネクローシス作業による不要部分の破壊
などの組み合わせによるのでしょう。
以上、シトおよび、エヴァにとってそれらの機能が重要であることと、どのような目的で使用されているかはおよそ想像つくのですが、１７話においてシンジらのパーソナルパターンを見てみると、驚くべきことに、なんとここでもアポトーシスパターンやアポビオーシスパターンが記録されています。
つまり、エヴァの生体維持だけでなく、パイロットの管理もアポトーシス・アポビオーシスなどの観点から行われているわけです。
人工培養するならともかく、なぜパイロットのアポトーシス・アポビオーシスが重要なのでしょうか。これには、以下のような観点から考える必要があると思われます。
２．精神分析
第２０話のグラフや、第２６話において、デストルドーとリビドーという言葉が現れます。
２６話 青葉「心理グラフ、シグナルダウン」
日向「デストルドーが形而下されていきます。」
冬月「これ以上は、パイロットの自我がもたんか」
デストルドーとは、無への本能（死への本能）であり、破壊する力。
リビドーとは生への本能（性の本能）であり、結びつける力を意味します。
エヴァンゲリオンとは、ある意味で、シンジおよび人類におけるデストルドーとリビドーの間の揺れ動きの世界です。２０話におけるシンジの内面におけるデストルドーとリビドー、２６話における人類規模でのデストルドーとリビドーなど。
なお、夏の映画の主題歌「タナトス」もデストルドーと同義です。リビドーとデストルドーは、ギリシア神話風に言えばエロスとタナトスとなります。
なお、フロイトはもともと自我保存欲動と性的欲動（リビドー）の対比を考えていましたが、第一次大戦における手足を失った兵隊たちの夢や、子供の遊技などの分析から、死への本能という観念に到達しました。これは、正確に言うと、エネルギーの乱れ（動き）をなくそうとする本能なのですが、その行き着くところは生まれる以前に戻ることであると考え、死の本能と名付けたのです。
さて、前章でふれましたように、遺伝子レベルにおいては、生体維持のための細胞死機能がアポトーシスであり、生体の寿命を決めるための細胞死機能がアポビオーシスでした。これらのパイロットデータが必要であったことと、リビドー、デストルドーのパイロットデータが必要であることを考えると、おそらく、この２者にはエヴァンゲリオンを動かすうえでのなんらかの関係があると思われます。
両者の関係は十分に明確ではありませんが、おおまかに言うと、
遺伝子 精神
生への本能 アポトーシス リビドー
死への本能 アポビオーシス デストルドー
と言った方向性が見えてきます。
３．生物学
第１５話において、加持とリツコの会話の中でホメオスタシスとトランジスタスという言葉がでてきます。
１５話 ミサト「変わんないわねぇ、そのお軽いとこ」
加持「いや、変わってるさ。生きるって事は変わるってことさ。」
リツコ「ホメオスタシスとトランジスタシスね。」
ミサト「何それ？」
リツコ「今を維持しようとする力と変えようとする力、その矛盾するふたつの性質を一緒に共有しているのが生き物なのよ」
加持「男と女だな」
ホメオスタシスとは、一般的には生体内の環境を調節して維持していく機能ですが、そのような限定した意味で言っているわけではないことは、リツコが「変えようとする力」との対比で語っていることからも明らかでしょう。
生命体には、今を維持しようとする力（ホメオスタシス）と、変えようとする力（トランジスタシス）という、二つの矛盾した力が共有されているわけです。
さて、前章で触れましたように、今を維持しようとする力はフロイトによって、死への本能と同義であると位置づけられました。また、リツコと加持の会話から伺えるように、
・生きること＝変わること（変えようとする力）＝トランジスタシス
です。
それと矛盾するのがホメオスタシスであると考えると、
・死ぬこと＝以前に戻ろうとすること（還ろうとする力）＝ホメオスタシス
と考えた方がしっくりきます。
そして、この矛盾する２者を併せ持つのが生物であり、正反対のベクトルをもつ２者の調整のうえに、生きていると考えられます（この調整機能の方が、一般的意味でのホメオスタシスに近い意味かとも思いますが）。
さて、この、リツコによる「矛盾するふたつの性質をもつのが生物」という定義から連想されるのは、言うまでもなく
遺伝子 精神
生への本能 アポトーシス リビドー
死への本能 アポビオーシス デストルドー
という先程の構図でしょう。遺伝子、深層心理など、現れている次元が異なるとはいえ、生物のもつふたつの矛盾する力が読みとれます。今回の用語を合わせると
遺伝子 精神 生物学
生への本能 アポトーシス リビドー トランジスタシス
死への本能 アポビオーシス デストルドー ホメオスタシス
となります。
なお、トランジスタシス（変わること、生きること）が行き着くとどうなるでしょうか。
第１３話 リツコ「排除の方法はあります。あのシトが進化を続けるなら、勝算はあります。」
ゲンドウ「進化の促進かね」
リツコ「はい」
ゲンドウ「進化の終着地点は自滅。「死」そのものだ」
冬月「ならば、進化をこちらで促進させてやればいいわけだな。」
シトにマギが侵入されたさい、リツコは進化の促進を提議します。つまり、「変わること」を究極まで進めると、それは「死」に到達します。結局、以前の状態に還る道を突き進めても「死（無）」であり、変わりつづけても「死」です。
２６話キール「始まりと終わりは同じ所にある。よい、すべてはこれでよい。」
これでは、結局死と生の円環を繰り返すことになります。これが「魂のルフラン（繰り返し）」という言葉のイメージとも結びついてきます。
生と死の本能の妥協点で生きる生物。そして、死はもちろん、生への方向を突き進めても、死にたどり着くしかないという円環状態。これは神秘学の世界です。
４．神秘学（カバラ）
２４話 カヲル「アダムに生まれしものは、アダムに還らねばならないのか。人を滅ぼしてまで。」
カバラにおいては、原初の一者（エイン・ソフ）から全てが流出し、全ての物が生み出されます。この、原初の状態に還ることが、問題となります。また、生命体レベルで言えば最初の生命体が巨大な原人アダム・カドモンです。エヴァンゲリオンにおいても、始源の状態への回帰を目指すゼーレと、進み続けるのを目指すゲンドウの対立がポイントとなります。
２５話ゼーレ「我らはヒトの形を捨ててまで、エヴァという名の方舟に乗ることはない。」
ゼーレ「神もヒトもすべての生命が、「死」をもって、やがて一つになるために。」
２６話において、シンジのエヴァンゲリオンは生命の木（図的にいうと、カバラにおける生命の木の図は、カバラにおける原初の巨大なアダムの図と相同でもあります）に還元され、リリスのデストルドーにより人類は原初の一者となります。なお、カバラにおいては、人はエイン・ソフに帰還するためには、何度も生まれ変わりを行う必要があります。このイメージもまた、「魂のルフラン」という曲名と結びついています。
なお、
カヲル「アダムに生まれしものは、アダムに還らねばならないのか。人を滅ぼしてまで。」
「未来を与えられる生命体はひとつしか選ばれないんだ。」
ゼーレ「神もヒトもすべての生命が、「死」をもって、やがて一つになるために。」
「アダムやシトの力は借りぬ」
「始まりと同じは同じ所にある、よい、すべてはこれでよい。」
というように、シトであるカヲルと、ゼーレとでは、「回帰」というテーマこそ共通ですが、大きな違いも存在します。
＜カヲル＞
・シトは、アダムから生まれしものとして、アダムに還らなくてはならない。
・それは、人類の滅亡を導く。
・ひとつの生命体は生き残る。
この３条件を結び合わせた結論は、
「シトはアダムに還元され、人類は滅亡し、アダムのみが、唯一の生命体として生き残る」
ということです。これは、原初の生命体としての巨人アダムから生命は始まり、そして、最後はすべての生命体がアダムに回帰するという、カバラ神学そのものです。
カバラ神学には存在しない唯一の考えは（私が知らないだけかもしれません。カバラ文献は無数に存在し、しかも日本に紹介されているものはほとんどないため）人類は、リリスの子リリンであり、アダムの子ら（シト）とは相容れない、という部分です（アダムとリリスの不和というのはユダヤ神話には存在します）。
「生き残るべき生命体」とカヲルが言うとき、問題になっているのは、シトの中のどれかか、もしくは、人類、という意味ではなく、アダムか、リリス（もしくは人類）という意味でしょう。なぜなら、カヲルが言うようにシトはアダムに還る運命ですし、シトの行動パターンをみても、自己保存欲動はそれほど強くないためです。同様に、ゼーレの思想では、人は、リリスの卵に還るのでしょう。
結局、
シトは、アダムの子として、アダムに回帰する（カバラ的側面）。それにより、おそらく、巨大な原人アダムは復活し、リリスおよびリリン（人類）は滅亡する。
ということでしょう。
もちろん、シトの性質はこれだけではありませんが、それは最重要ＱＡ集の「シトとは何か」などを参照願います。
ここでは、以上あげたシトの回帰への方向性とゼーレとを対比します。
＜ゼーレ＞
セカンドインパクトの目的は、ミサトの情報では
２５話「他のシトが覚醒する前にアダムを卵にまで還元することによって、被害を最小限に食い止めるため」
ゼーレが何もしなければそもそもセカンドインパクトは起きず、シトも覚醒しなかったのではないかという疑問もありますが、ひとまず、アダムを卵に還元したために他のシトが覚醒しても被害が抑えられたという面はあったでしょう。例えば、カヲルは、地下の巨人がリリスであると知り、「アダムに還ること」をあきらめます。
結局、ゼーレは、シトと同様に始源への回帰をはたしたかったのですが、シトが彼らの生命の源（アダム）に還ることは妨害したわけです。
シトにしても、ゼーレにしても、お互いに相手を憎んでいるというよりは、ただ単に自分の源へと回帰を図りたかっただけだと思われます。しかし、アダムとリリスの敵対関係のため、また、人は生命の木を手に入れるためにはシトを倒さなくてはならなかったため、両者は戦う運命に合ったと言えるでしょう。
ゼーレはシトを倒すために様々な事を行ったと思われますが、そのひとつにシトの行動パターンの予測があります。
（参考）動物行動学
動物の行動パターンは様々です。しかし、それぞれの動物には固有の認識パターンおよび、本能を発現させるパターンが存在します。そして、そのパターンにはまっているものについては、それが真実であるか否かにかかわりなく、決められた本能パターンにそって行動を起こすことになります。
おそらく、キールの専門のひとつは、シトに対しても認識パターンを見抜き、行動を制御して、必ず、エヴァが活動できる条件範囲にシトを誘い込むことだったのではないでしょうか。
エヴァにおいては、必ず、エヴァが動ける範囲にシトは来ます。多くのシトはNERV本部を目指しているようですが、アダムへの接触が第一目標であるようなものもあれば、自爆してでもエヴァを倒そうとするものもあり、必ずしも行動パターンは一定ではありません。それでいながら必ずエヴァの行動範囲にやってくるのは、まさにそれぞれが固有の本能的な罠にはめられているからかと思われます。
キール・ローレンツの名称上のモデルは学者のコンラート・ローレンツであり（企画書においてはこの名前がそのまま使われている）、動物の比較行動学でノーベル賞をとった人です。彼の研究には様々な動物の遺伝的行動パターンおよびその触発のさせ方などが観察・分析されています。
＜ゲンドウ＞
シトも、ゼーレも、それぞれ魂の源への回帰を目指していたのですが、ゲンドウは、はっきりと異なります（ゲンドウの真実参照）。
彼は、
２６話ゲンドウ「人は、新たな世界へと進べきなのです。そのためのエヴァシリーズです。」
ゲンドウ「死は何も生みませんよ。」
というように、進み続けることを目指していました。
また、
２１話「そうだ。かつて、誰もがなしえなかった神への道、人類補完計画だよ。」
というように、究極まで進みつづけることを目標としていたのです。
遺伝子 精神 生物学
生への本能 アポトーシス リビドー トランジスタシス
死への本能 アポビオーシス デストルドー ホメオスタシス
という図につけ加えるなら、
神秘学（カバラ） グループ
生への本能 神への道（エヴァによる人類補完計画） ゲンドウ
死への本能 生命の源（アダム、リリス）への回帰 ゼーレ、シト
といったところです。
５．聖書学
１７話冬月「かつて楽園を追い出され、死と隣り合わせの地上という世界に逃げるしかなかった人類。その最も弱い生物が、弱さゆえ手にいれた知恵で作り出した、人類の楽園だよ」
知恵を手に入れた原罪により、楽園（エデン）から人類は追放されます。知恵の実を最初に食べたのはエヴァです。女性はこの罪により、出産の苦しみを与えられます。これが、人類にとって性と生（無限の生命ではなく、有限の生命が交配により子孫を残す）が芽生えた瞬間です。エヴァにおいて出産シーン（１９話）が多重的な意義をもつ所以であります。
２５話キール「忌むべき存在のエヴァ、またもわれらの防げとなるか」
キール「やはり、毒は同じ毒をもって制すべきだな」
一方、いかに贖罪し、元の状態へと回帰することがポイントとなります。キリスト教の発生に重要な役割を果たしていると考えられるエッセネ派および、その教典である死海文書は、強い終末論に特徴があります。また、キリストの十字架上での死は人の原罪を償うためのものなのですが、その象徴であるロンギヌスの槍もゼーレにより死海で発見されております。
１７話冬月「ゼーレ（脚本では「エッセネ」）もあわてて行動表を修正してるだろう。」
ゲンドウ「死海文書にない事件も起こる、老人にはいい薬だろう。」
２６話ゼーレ「悠久の時を示す、赤き土（アダム）の禊ぎをもって、〜」
ゼーレ「まずはジオフロントを真の姿に」
ここでは、ゼーレは、エッセネ派と関連づけされています。つまり、贖罪を行い、楽園（始まり）への回帰を目指すゼーレと、エヴァが手にいれた知恵の実の力により、人間自身が神になろうとするゲンドウとの違いが、はっきりしております。
聖書
生への本能 エヴァ（知恵の実）
死への本能 楽園（死海文書）
６．音楽（曲）
「ＦＬＹ ME TO THE MOON」、「魂のルフラン」、「THANATOS」などは、どれも始源への回帰がテーマとなっております。また、２４話でのベートーベンの第９におけるシラーの詩も、神への憧憬あふれるバッハの音楽などを含めても、全ての曲が、始源への回帰（約束の日の到来）のあこがれを目指しているといえるでしょう。
ＦＬＹ ME TO THE MOON
「ＦＬＹ ME TO THE MOON（この言葉の含意するところは、神話におけるエヴァンゲリオン象徴辞典「月へ還る美少女」参照）
魂のルフラン
「私に帰りなさい。生まれる前に」
THANATOS
これはいわゆるタナトス（死への本能）です。デストルドーと同義。
甘き死よ来たれ
「無へと還ろう 無へと還ろう それは、優しさに満ちたところ 真実の痛みのないところ」
これに対して、未来を志向した、生きることを歌った唯一の曲が「残酷な天使のテーゼ」です。
残酷な天使のテーゼ
「だけどいつか気づくでしょう、その背中には。はるか未来目指すための羽根があること。」
以上、６分野にわたって概観しましたが、結局のところ同じ原理に基づいているのが分かると思います。
音楽
生への本能 残酷な天使のテーゼ
死への本能 魂のﾙﾌﾗﾝ／fly me to the moon／THANATOS／甘き死よ来たれ
７．最後に（進化論）
様々な衒学趣味に彩られたエヴァンゲリオンですが、そこで使用されている重要概念は、死（始源への回帰）と新生を巡って構成されております。
簡略化して、まとめてかくと、
遺伝子 精神分析 生物学 神秘学 聖書 音楽
生 ｱﾎﾟﾄｰｼｽ ﾘﾋﾞﾄﾞｰ ﾄﾗﾝｼﾞｽﾀｼｽ エヴァ 知恵の実 残酷な天使のテーゼ
死 ｱﾎﾟﾋﾞｵｰｼｽ ﾃﾞｽﾄﾙﾄﾞｰ ﾎﾒｵｽﾀｼｽ アダム 死海文書 魂のルフラン
となります。
リツコのいった、二つの矛盾した性質をかかえる存在である生き物同様、エヴァンゲリオンという作品も二つの相反する力の拮抗の中に存在していると言っていいでしょう。
ひとつ付け加えるなら、興味深いのは
「進化の終着地点は自滅。死そのものだ。」
というゲンドウの言葉です。つまり、死を目指しても、生を目指しても、究極の到達点は同じ所にあるということをゲンドウは知っていたのです。この、魂のルフラン（まさに輪廻）の中にあって、ゲンドウはなぜ神への道を歩もうとしたのか。キールがゲンドウの意図を理解できなかったのもおそらくはそこにあります。進化を極めたところにあるのは、しょせん死そのものであると知っているにも関わらず、なぜそんな、神になるというまわり道をしてから死に向かうのか。今すぐすべてを原初の状態に返し、
キール同様「始まりと終わりは同じ所にある。よい、すべてはこれでよい。」
とつぶやく方がいいのではないか。ゼーレが死を望むのも、
２６話「これは通過儀式なのだ。閉塞した人類が再生するための」
「滅びの宿命は新生の喜びでもある」
というように、死（始源への回帰）を極めることにより新生を見いだすためのものだからです。死を極めれば生になり、進化を極めれば死になる以上、ゲンドウが今更進化にこだわる理由がゼーレには理解できなかったでしょう。実際、シンジにおいて、デストルドーが極まった後にはリビドーが発生したように（シンジはなぜアスカの首をしめたか参照）。
これに対する答えは、
リツコ「シトが死の効率的な回避を考えれば、マギとの共生を選択するかもしれません。」
という言葉にあると思われます。
生と死（進化と無への回帰）の輪廻の中から抜け出すためには、進化し続けるのではなく、ある地点で意識的に進化をやめる必要があります。それには、生殖による交配という、遺伝子が変化する可能性（進化する可能性）をもつ形態ではなく、シトのようにアポトーシス制御ができる肉体において、すべての魂をひとつにまとめるのが最適です。
進化の輪廻からの脱出、それが、「完全な単体としての生物へと人工進化させる補完計画」という、人類補完計画によりゲンドウが実現しようとしていた事の一つではなかったでしょうか。