対象ファイルを指定すると、指定されたファイルのみをバックアップの対象とします。除外ファイルを指定すると、指定されたファイルをバックアップの対象から除外します。
何も設定していない場合は、すべてのファイルをバックアップの対象とします。
（対象・除外ファイルの設定方法）
（除外フォルダの設定方法）

新しいファイル・新しい時刻・異なるサイズ・すべて上書きコピー、などを指定できます。

実際にコピーする前に、コピーするファイルをあらかじめチェックできるプレビュー機能があります。
プレビューでコピー不要なファイルがある場合は、コピーファイル一覧から削除することができます。
（バックアッププレビューの表示方法）

一定間隔ごと、指定時刻などの自動バックアップができます。
（BunBackupの自動バックアップの設定方法）
Windowsのタスクを利用した自動バックアップも可能です。
（タスクを利用した自動バックアップの設定方法）

バックアップの場合、ファイルのコピーに時間がかかるのは当然ですが、バックアップ元・先フォルダにあるファイルの情報の収集にも時間がかかります。
「高速ファイルチェック」は、バックアップ先のファイル情報をキャッシュすることで、高速なバックアップが可能にしています。

ファイルの変更履歴を、バックアップごとに世代管理用フォルダに保存していくことができます。

バックアップの結果をファイルに記録します。
記録したログは後から表示させることができます。
（ログの設定方法）

バックアップ元のファイルが削除されている場合、バックアップ先のそのファイルを削除します。
なお、バックアップ元ファイル保護のため、バックアップ先のファイルが削除されていても、バックアップ元のファイルは削除されない安全設計になっています。
（ミラーリングの設定方法）

ファイルを暗号化してコピーします。
暗号化はBlowfishアルゴリズムを使用しています。

BunBackupのロックファイルコピー機能を利用すると、読み込みをロックしているファイルをコピーできるようになります。

大量のファイルをバックアップし、通常のバックアップではメモリ不足になる場合、省メモリバックアップを使用すると、少ないメモリ使用量でバックアップすることができます。