第零話　はじめにお読みください	はじめに キャラ設定集	読まないでも大した事はないですが、 思春期の世界が分かりやすくなる（かも）
第壱話　蒼髪の小悪魔	蒼髪の子悪魔	第壱中にやってきた激烈美少女転校生 それが全ての始まりだった
第弐話　突然の来訪者	Ａパート Ｂパート Ｃパート Ｄパート Ｅパート	突然の同居人綾波レイ 両親の暖かい善意か、はたまた陰謀か？ 二人きりの夜、何ともありがちな展開にシンジは！！
第参話　嬉し恥ずかし夏休み	Ａパート Ｂパート Ｃパート Ｄパート Ｅパート Ｆパート	突然持ち出された旅行 用意されたお膳立て 旅先で起こるモノとは！？
第四話　あなたとスキャンダル	Ａパート Ｂパート	謎の美少年転校生、渚カヲル シンジに迫りくる彼にアスカとレイは焦る
第五話　過去の清算	Ａパート Ｂパート Ｃパート	愛する者との突然の再開 六年ぶりのラブ・ストーリー その時ミサトは何を思う
第六話　雪の夜	予告 Ａパート Ｂパート Ｃパート Ｄパート Ｅパート Ｆパート	クリスマス・イブ 幸せな者も幸せでない者も、 平等にやってくる聖なる日 必ず何かが起こるであろう夜に子供達は
第七話　気がつけばお約束	予告 Ａパート Ｂパート Ｃパート	雪山に一人佇むシンジ 何が起こったのかも分からず、彼は混乱する そして、雪山で出会った一人の少女 予想外の出来事にカヲルも混乱する
第八話　彼氏彼女の事情	Ａパート Ｂパート Ｃパート Ｄパート Ｅパート	突然の転入生暁ルリ 意味深なカヲルの言葉 ２−Ａが騒然となった二人の関係とは？
第九話　思うまま、わがままに	Ａパート Ｂパート Ｃパート Ｄパート Ｅパート Ｆパート Ｇパート	クラス替え それは、学校生活最大の難所 目前に迫るクラス替えに対して、レイが考えついた事とは？
第拾話　魔法少女プリティールリルリ	Ａパート Ｂパート Ｃパート Ｄパート Ｅパート	文化祭の季節 第壱中にも例外なく訪れるお祭り ミサトが出したアイディアとは！？
第拾壱話　Last regrets	Ａパート Ｂパート	天才科学者、赤木リツコ。 科学者として前途洋洋であった彼女が、 教師になった理由とは？
第拾弐話　To Heart	Ａパート Ｂパート Ｃパート Ｄパート Ｅパート Ｆパート Ｇパート Ｈパート	辛い別れと共にまた一歩大人への階段を上る子供たち。 一瞬で通り過ぎていった中学生活。 たくさんの出会いがあった中学校。 嬉しい事も、悲しい事も、楽しい事も辛い事も。 その全てを胸に秘めて、今、子供達は卒業する。
番外壱　ヒカリの料理教室	ヒカリの料理教室	料理の話に花を咲かせるレイとヒカリ 不安になるアスカ そこで彼女が決意した事とは
番外弐　天国と地獄	天国と地獄	学生最大の試練、定期テスト 美少女二人の学習指南 人も羨む試験勉強 シンジの成績の行方はいかに