XyMTeX Ver 5.00aの紹介

by Shinsaku Fujita

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(最新版) XyMTeX Version 5.00a (2010/11/22)

XyMTeX Version5.00a (バグフックス版)では，chemist.styおよびchemtimes.styにおける数式記号やギリシア文字に関するバグを訂正しました．旧配布物では，たとえば，$a^{\star}$とすれば処理ができましたが，中括弧をはずして$a^\star$とするとエラーとなりました．これを，$a^{\star}$でも$a^\star$でも処理できるようにしました．

これまでの配布物

XyMTeXの詳細に関しては，拙著を参照してください．
XyMTeX Version5.00aの基本的な命令の仕様は， Version 1.01のものを踏襲してあります．これらについては，拙著に詳しく書いてありますので，参照してください．また，このサイトでもオンライン版 (Version 1.01 オンラインマニュアル (xymtex.pdf)が手にはいります．
XyMTeX Version2.00での拡張部分は，線型表現 (linear notation)として定式化し，XyM Notationをいう名称で呼んでいます．すなわち，XyM Notationの TeXによる出力ソフトウエアがXyMTeXという位置付けになります．XyM Notationに関しては，
Shinsaku Fujita and Nobuya Tanaka, ``XyM Notation for Electronic Communication of Organic Chemical Structures,''
J. Chemical Information and Computer Sciences, 39, 903--914 (1999)
に論文を発表していますのでご覧ください．この論文のオンライン版 (CI990018X)が次のサイトから読めます．ただし，購読料が必要です．
Journal of Chemical Information & Computer Sciences ASAP Table of Contents:
http://pubs.acs.org/subscribe/journals/jcisd8/browse_asap.html
Direct link to CI990018X
http://dx.doi.org/10.1021/CI990018X
XyMTeX Version3.00での拡張部分は，構造式の大きさを可変にできるようにしたことです．もちろん，旧バージョンの機能は，すべて継承しています．
XyMTeX Version4.01での拡張部分は，PostScript対応にしたことです．PostScript にしないようにすることもできます．旧バージョンの機能は，すべて継承しています．
XyMTeX Version4.02での拡張部分は，立体化学用の楔形結合の出力に対応したことです．楔形結合は，PostScript互換モードで使えます． TeX/LaTeXモードでは，楔形結合は，太線の結合で代用されます．旧バージョンの機能は，すべて継承しています．
XyMTeX Version4.03での拡張部分は，立体化学用の波形結合の出力に対応したことです．波形結合は，PostScript互換モードで使えます． TeX/LaTeXモードでも同様に使えますが，実現方法が異なるので仕上がりは PostScript互換モードとは多少異なります．旧バージョンの機能は，すべて継承しています．
XyMTeX Version4.04での拡張部分は，ステロイド出力命令の拡充です． TeX/LaTeXモードもPostScript互換モードでも使えますが，十分に使用するにはPostScript互換モードで使うことを推奨します．旧バージョンの機能は，すべて継承しています．
XyMTeX Version4.05での拡張部分は，(A) Lewis構造を出力するためのマクロ集lewisstruc.styを新設，(B) chemist.sty (chmst-ps.sty)のchem, boldchemパージョンの再定義とChemEquation環境や矢印類の出力命令などの新設，(C) Times系のフォントによる出力のためのchemtimes.styの新設です．TeX/LaTeXモードもPostScript互換モードでも使えますが，十分に使用するにはPostScript互換モードで使うことを推奨します．旧バージョンの機能は，すべて継承しています．
XyMTeX Version4.06での拡張部分は，chmst-psパッケージに銛型矢印(harpoons)の描画命令を追加したことです．このため，Version 4.05の三つのマニュアルのうち， xymtx405B.pdfおよびxymtx405B.pdfを加筆改訂して， xymtx405406B.pdfおよびxymtx405406B.pdfとしました．xymtx405A.pdfはそのままにしてあります．旧バージョンの機能は，すべて継承しています．
XyMTeX Version5.00での拡張部分は，これまでのTeX/LaTeXモード(xymtexパッケージで起動)と PostScript互換モード(xymtexpsパッケージで起動)に加えてPDF互換モード(xymtexpdfパッケージで起動)を実装したことです．これによりdvipdfmxなどのコンバーターで直接に処理できるようになりました．また，結合や置換基の部分カラー化もできるようにしました．旧バージョンの機能は，すべて継承しています．

(最新版) XyMTeX Version 5.00aの概要

readm500a.jpn 
Notes for XyMTeX (in Japanese)
Copyright (C) 1993, 1996, 1998, 2001, 2002, 2004, 2005, 2009, 2010 by Shinsaku Fujita. 
All rights reserved. 
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readm500.jpn 
Notes for XyMTeX (in Japanese)
Copyright (C) 1993, 1996, 1998, 2001, 2002, 2004, 2005, 2009, 2010 by Shinsaku Fujita. 
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readm406.jpn 
Notes for XyMTeX (in Japanese)
Copyright (C) 1993, 1996, 1998, 2001, 2002, 2004, 2005, 2009 by Shinsaku Fujita. 
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readm405.jpn 
Notes for XyMTeX (in Japanese)
Copyright (C) 1993, 1996, 1998, 2001, 2002, 2004, 2005, 2009 by Shinsaku Fujita. 
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Notes for XyMTeX (in Japanese)
Copyright (C) 1993, 1996, 1998, 2001, 2002, 2004, 2005, 2009 by Shinsaku Fujita. 
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Notes for XyMTeX (in Japanese)
Copyright (C) 1993, 1996, 1998, 2001, 2002, 2004, 2005 by Shinsaku Fujita. 
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readm402.jpn 
Notes for XyMTeX (in Japanese)
Copyright (C) 1993, 1996, 1998, 2001, 2002, 2004 by Shinsaku Fujita. 
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readm400.jpn 
Notes for XyMTeX (in Japanese)
Copyright (C) 1993, 1996, 1998, 2001, 2002 by Shinsaku Fujita. 
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readm300.jpn 
Notes for XyMTeX (in Japanese)
Copyright (C) 1993, 1996, 1998, 2001, 2002 by Shinsaku Fujita. 
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readm201.jpn 
Notes for XyMTeX (in Japanese)
Copyright (C) 1993, 1996, 1998, 2001 by Shinsaku Fujita. All rights reserved. 
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(旧)readme2.jpn 
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(旧)readme1.jpn 
Notes for XyMTeX (in Japanese)
Copyright (C) 1993, 1996 by Shinsaku Fujita. All rights reserved. 
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名  称: XyMTeX
登録名: xymtx500a.zip for drawing chem. structures
概  要: 化学構造式を描くためのマクロパッケージ
　　　   (LaTeX用のパッケージファイル類を含む)
鍵  語: LaTeX, 化学, 構造式
作  者: Shinsaku Fujita (藤田 眞作)
登録者: 藤田 眞作
最新版: 5.00
本  籍: http://xymtex.com/fujitas3/xymtex/index.html
覚  書: ドキュメントは、
xymtex.pdf, 
xymtx200.pdf, xymtx300.pdf, xymtx400.pdf, 
xymtx401.pdf, xymtx402403.pdf, xymtx404.pdf, 
xymtx405A.pdf, xymtx405406B.pdf, xymtx405406C.pdf, 
xymtx500.pdf. 
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Name: XyMTeX
Description: Macro Package including LaTeX document-style options for 
             typesetting chemical structural formulas
Keywords: LaTeX, chemistry, structural formula
Author: Shinsaku Fujita
Supported: http://xymtex.com/
Latest Version: 5.00a (bug fixed)
Archives: http://xymtex.com/fujitas3/xymtex/indexe.html
Note: Documentation in xymtex.pdf, 
xymtx200.pdf, xymtx300.pdf, xymtx400.pdf, 
xymtx401.pdf, xymtx402403.pdf, xymtx404.pdf, 
xymtx405A.pdf, xymtx405406B.pdf, xymtx405406C.pdf, 
xymtx500.pdf. 
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＜説明＞
　XyMTeXは、化学構造式を描くためののマクロパッケージです。 これは、
LaTeX2e用のパッケージファイル群から成り立っています。各ファイルには
化学構造式を描くためのコマンドのマクロコードが含まれています。各コマンドは、
広範囲の化合物の構造が描けるように、新しい構想のもとに作成したものです。
LaTeXのpicture環境を前提にして、その範囲内 (図形組版)で構造式が描けるように
なっています。したがって、構造式出力のプリンターは (プリンタードライバーさえ
あれば) 種類を選ばず、たとえば写植機でも出力が可能です。Version 4.00で
PostScript対応としました．XyMTeX Version4.03をPostScriptモードで使用した場合
には，PostScriptプリンターまたはそれにかわるものが必要です．Version 4.04では，
ステロイド類を描画するためのsteroid.styを作成しました．Version 4.05では，
Lewis構造用の孤立電子対を描くためのマクロを用意しました(xymtx405A.pdf)．また，
chemist.styを改良して，数式バージョンchemやboldchemでの文字化けをできるだけ
なくすようにし，PostScript対応(chmst-ps.sty)のときの矢印類を整備しました
(xymtx405B.pdf)．さらに，chemtimes.styを新設して，Times系のフォントを地の文
でも，数式(数式バージョンnormal, bold, chem, boldchem)でも使えるようにしました
(xymtx405C.pdf)．

　Version 5.00a (bug fixed)では，chemist.styおよびchemtimes.styのバグを訂正
しました．旧配布物では，たとえば，$a^{\star}$とすれば処理ができましたが，
中括弧をはずして$a^\star$とするとエラーとなりました．これを，$a^{\star}$
でも$a^\star$でも処理できるようにしました．

　Version 5.00では，これまでのPostScript対応に加えて，
PDF対応モードを追加しました(xymtx500.pdf, xymtx500PS.pdf)．この結果，dvipdfmxなど
でdviファイルを直接にPDFに変換できるようになりました．また，特定の結合や置換基を
着色する機能を追加しました．

＜マニュアル類＞
　Version 5.00a用のマニュアルはVersion 5.00用のマニュアルで代用します．
xymtx500.pdfとxymtex500PS.pdfです．二つの
マニュアルは同一内容ですが，xymtx500.pdfはPDF対応モードで組版したもの，
xymtx500PS.pdfはPS対応モードで組版したものです．

======旧バージョンに関する説明．マニュアルは現バージョンでも有効です=========
　Version 4.06用のマニュアルは，xymtx405406B.pdfとxymtex405406C.pdfです．これらは
Version　4.05用のマニュアルxytx405B.pdfとxymtx405C.pdfに，Version 4.06の開発項目
(銛型矢印)の説明を追加したものです．xymtx305A.pdfはそのまま通用します．

　Version 4.05用のマニュアルは3種類あります．xymtx405A.pdfは，Lewis構造用の孤立電子対を
描くためのマクロを中心に説明しました．xymtx405B.pdfは，chemist.styの改良に関するもの
です．実例を示して，数式バージョンchemやboldchemでの文字化けについて詳細に説明しました．
またPostScript対応(chmst-ps.sty)での矢印類についても説明しました．
xymtx405C.pdfでは，新設したchemtimes.styについて説明してあります．
Times系のフォントを，地の文でも，数式(数式バージョンnormal, bold, chem, boldchem)でも
使えることを実例で示しました．

　Version 2.00用に約100ページのマニュアル (xymtx200.pdf) が付属しています。
この中に、Version 2.00で追加した機能とコマンドの書式 (仕様) と描画例を
多数記載しましたので、解凍後、まずどのようなことができるのかをご覧ください。

　Version 3.00用に約10ページのマニュアル (xymtx300.pdf) が付属しています。
この中に、Version 3.00で追加した機能とコマンドの書式 (仕様) と描画例を
多数記載しましたので、解凍後、まずどのようなことができるのかをご覧ください。

　chemist.styやmathchem.sty (下記拙著に付録として付いている
フロッピーディスクに収録)に含まれるコマンドを併用すれば、さらに
いろいろな反応スキームなどを描くことができるようになります。
XyMTeX(version1.01)から、chemist.styも同梱してあります。

　Version 4.00用に24ページのマニュアル(xymtx400.pdf)が付属しています．
PDFファイルですから，閲覧やプリントアウトは，Acrobat Readerなどを用いてください．
xymtx400.dviは，\specialのコードを含んでいますので，対応していないdvi-wareでは
読めません．

　Version 4.01用に33ページのマニュアル(xymtx401.pdf)が付属しています．
PDFファイルですから，閲覧やプリントアウトは，Acrobat Readerなどを用いてください．
xymtx401.dviは，\specialのコードを含んでいますので，対応していないdvi-wareでは
読めません．

　Version 4.02, 4.03用に45ページのマニュアル(xymtx402403.pdf)が付属しています．
PDFファイルですから，閲覧やプリントアウトは，Acrobat Readerなどを用いてください．
xymtx402403.dviは，\specialのコードを含んでいますので，対応していないdvi-wareでは
読めません．

　Version 4.04用のマニュアル(xymtx404.pdf)は，追加したステロイド類の命令と出力
を示したものです．PDFファイルですから，閲覧やプリントアウトは，Acrobat Readerなどを
用いてください．xymtx404.dviは，\specialのコードを含んでいますので，対応していない
dvi-wareでは読めません．


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基本的な使用法は、XyMTeX verion 5.00aも以前のバージョンでも同じです。
このため、付属のマニュアルでは、基本的な使用法を記載してありません。
基本的な使用法は，xymtex.pdfというオンラインマニュアルをホームページ
http://xymtex.com/にアップロードしてありますので参照してください．また，
このホームページには，日本語マニュアルも用意してあります．

さらに詳しくは，次のレファレンスマニュアルを参照してください。

     「XyMTeX--Typesetting Chemical Structural Formulas」
      藤田眞作著、アジソン・ウェスレイ・ジャパン (1997) CD-DOM付

また次の拙著も参考にしてください．

     「化学者・生化学者のためのLaTeX---パソコンによる論文作成の手引」
     藤田 眞作 著、東京化学同人 (1993) FD付

＜ダウンロード・解凍＞
(1) ファイル名xymtx500a.zipでダウンロードしてください
(2) TeXのパスの通っているディレクトリー内で解凍してください。

　　昨今では，優秀なフリーの解凍ソフトウェアが入手できますので，
　　さらに便利に解凍できます．入手した解凍ソフトウェアの指示に
　　したがってxymtx500a.zipを解凍してください．

インストールの概略の手順は、xymtx500a.jpnをご覧下さい。

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